مرجع صدور گواهینامه GMP موضوع پرسمان برخی از متقاضیان است. متقاضیان اخذ گواهینامه GMP به طور کلی به دو دسته وارد کننده و صادر کننده تقسیم بندی می شوند. شرکت هایی که می خواهند اقدام به واردات محصولات نمایند براساس دستورالعمل سازمان غذا دارو ایران باید اقدام به اخذ گواهینامه GMP نمایند. نکته مهم اینکه سازمان فقط گواهینامه GMP نهادهای صادر کننده گواهینامه ای را تایید می کند که توسط غذا دارو تایید شده باشند. پس از انتخاب مرجع صدور گواهینامه GMP که مورد تایید سازمان غذا دارو باشد، متقاضی باید نسبت به استقرار الزامات GMP مورد تایید سازمان اقدام نماید.

سازمان غذا دارو الزامات مربوط به قوانین، آئین نامه ها، دستورالعمل ها و مقررات برای غذا و آشامیدنی، دارو، تجهیزات و ملزومات پزشکی، محصولات غذایی و مکمل ها، آرایشی و بهداشتی و آزمایشگاه ها را در سایت خود آپلود کرده است. لذا متقاضیان اخذ گواهینامه GMP توسط سازمان غذا دارو باید اقدام به دانلود مدارک کرده سپس اقدامات را پیاده سازی و پیروی کنند. در نهایت آمادگی خود را جهت حسابرسی برای صدور گواهینامه GMP اعلام کنند.

دسته دوم متقاضیان اخذ گواهینامه GMP صادر کننده محصولات غذایی هستند که جهت ورود به بازارهای بین المللی و بحث برندینگ کالا اقدام به اخذ گواهینامه GMP می کنند. مرجع صدور گواهینامه GMP باید توسط انجمن بین المللی GFSI تایید و مجوز حسابرسی همچنین صدور گواهینامه را دریافت نماید. به دلیل تحریم های یک جانبه و یک طرفه این انجمن نهادی را داخل ایران برای حسابرسی و صدور گواهینامه GMP مشخص نکرده است. بنابراین اخذ گواهینامه GMP معتبر در ایران برای متقاضیان امکان پذیر نمی باشد.

متقاضیان اخذ گواهینامه GMP در ایران می توانند به دو روش اقدام به دریافت این گواهینامه نمایند. در روش اول که مورد تایید سازمان های داخلی می باشد اخذ گواهینامه از سازمان غذا دارو است و در روش دوم این گواهینامه توسط مراجع صدور گواهینامه ایزو صادر می شود. مرجع صدور گواهینامه ایزو در ایران به صورت نانواکریدیت اقدام به صدور گواهینامه GMP می کند. یعنی اینکه گواهینامه GMP صادر شده مورد تایید انجمن GFSI همچنین سازمان FDA امریکا نیست.

مرجع صدور گواهینامه ایزو در ایران گواهی GMP را هم صادر می کند که این مراجع نیز دو سطح اعتباری متفاوت دارند. مراجعی که گواهینامه ایزو بین المللی یا اصل صادر می کنند و مراجعی که گواهینامه ایزو از AB های خصوصی صادر می کنند. مراجعی که اعتبار بین المللی دارند و توسط انجمن اعتبار دهنده بین المللی IAF تایید می شوند اقدام به صدور گواهینامه GMP می کنند منتها به صورت نانو اکریدیت. مراجعی در ایران به وجود آمده اند که تحت اعتبار کشور انگلیس، کانادا، آلمان یا ایتالیا اقدام به صدور گواهینامه GMP می کنند. متقاضیان اخذ گواهینامه GMP از این مراجع می توانند با حداقل قیمت و در مدت زمان کوتاه اقدام به اخذ گواهینامه GMP نمایند.